| size | 4778 |
| size_real | 4778 |
| ecount | 226406 |
| supercluster | 4 |
| annotations_summary | 9.67% Class_I/LTR/Ty3_gypsy/chromovirus/Tekay:Ty3-CHDII 0.02% Class_I/LTR/Ty3_gypsy/chromovirus/Reina:Ty3-RH 0.02% Class_I/LTR/Ty1_copia/SIRE:Ty1-INT 0.02% Class_I/LTR/Ty1_copia/Ale:Ty1-RT 0.02% Class_I/LTR/Ty3_gypsy/chromovirus/Tekay:Ty3-INT 0.02% Class_I/LTR/Ty1_copia/Ale:Ty1-RH |
| pair_completeness | 0.403642773207991 |
| pbs_score | None |
| TR_score | None |
| TR_monomer_length | None |
| loop_index | 0.0046044370029301 |
| satellite_probability | 6.52979343237575e-21 |
| consensus | None |
| TAREAN_annotation | Other |
| orientation_score | 1 |
| Species | Read count |
|---|---|
| S2 | 1480 |
| S1 | 1620 |
| S3 | 1670 |
| S2 | S1 | S3 | |
|---|---|---|---|
| S2 | 23500 | 24600 | 24900 |
| S1 | 24600 | 25700 | 26000 |
| S3 | 24900 | 26000 | 26200 |
| S2 | S1 | S3 | |
|---|---|---|---|
| S2 | 0.999 | 1.000 | 1.000 |
| S1 | 1.000 | 0.998 | 1.000 |
| S3 | 1.000 | 1.000 | 0.998 |
protein domains:
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|
CL42 ----> CL44
No. of shared pairs: :697
CL42 ----> CL55
No. of shared pairs: :210
CL42 ----> CL71
No. of shared pairs: :95
CL42 ----> CL54
No. of shared pairs: :58
CL42 ----> CL198
No. of shared pairs: :36
CL42 ----> CL29
No. of shared pairs: :34
CL42 ----> CL78
No. of shared pairs: :30
CL42 ----> CL14
No. of shared pairs: :11