| size | 5166 |
| size_real | 5166 |
| ecount | 145403 |
| supercluster | 3 |
| annotations_summary | 0.04% Class_I/LTR/Ty3_gypsy/chromovirus/Tekay:Ty3-INT 0.04% Class_I/LTR/Ty3_gypsy/non-chromovirus/OTA/Ogre_Tat/TatIV_Ogre:Ty3-INT 0.02% Class_I/LTR/Ty3_gypsy/non-chromovirus/Phygy:Ty3-INT 0.02% Class_I/LTR/Ty1_copia/Gymco-II:Ty1-RT 0.02% Class_I/LTR/Ty1_copia/Ale:Ty1-RH |
| pair_completeness | 0.468447981807845 |
| pbs_score | None |
| TR_score | None |
| TR_monomer_length | None |
| loop_index | 0.00154858691444057 |
| satellite_probability | 3.54668226065428e-21 |
| consensus | None |
| TAREAN_annotation | Other |
| orientation_score | 1 |
| Species | Read count |
|---|---|
| S2 | 1680 |
| S1 | 1830 |
| S3 | 1650 |
| S2 | S1 | S3 | |
|---|---|---|---|
| S2 | 15400 | 16200 | 15700 |
| S1 | 16200 | 17200 | 16700 |
| S3 | 15700 | 16700 | 15800 |
| S2 | S1 | S3 | |
|---|---|---|---|
| S2 | 1.000 | 0.994 | 1.000 |
| S1 | 0.994 | 0.999 | 1.010 |
| S3 | 1.000 | 1.010 | 0.989 |
protein domains:
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|
CL38 ----> CL1
No. of shared pairs: :376
CL38 ----> CL21
No. of shared pairs: :215
CL38 ----> CL12
No. of shared pairs: :53
CL38 ----> CL56
No. of shared pairs: :15
CL38 ----> CL74
No. of shared pairs: :12
CL38 ----> CL16
No. of shared pairs: :11
CL38 ----> CL37
No. of shared pairs: :10