| size | 5839 |
| size_real | 5839 |
| ecount | 108225 |
| supercluster | 1 |
| annotations_summary | 0.03% organelle/mitochondria 0.02% Class_I/LTR/Ty1_copia/Ivana:Ty1-RT 0.02% Class_II/Subclass_2/Helitron:Helitron-HEL2 0.02% Class_I/LTR/Ty3_gypsy/non-chromovirus/OTA/Ogre_Tat/TatV:Ty3-RT 0.02% organelle/plastid |
| pair_completeness | 0.542668428005284 |
| pbs_score | None |
| TR_score | None |
| TR_monomer_length | None |
| loop_index | 0.000685048809727693 |
| satellite_probability | 1.65508917325132e-21 |
| consensus | None |
| TAREAN_annotation | Other |
| orientation_score | 1 |
| Species | Read count |
|---|---|
| S2 | 1920 |
| S1 | 1970 |
| S3 | 1950 |
| S2 | S1 | S3 | |
|---|---|---|---|
| S2 | 11700 | 12300 | 11500 |
| S1 | 12300 | 13000 | 12200 |
| S3 | 11500 | 12200 | 11500 |
| S2 | S1 | S3 | |
|---|---|---|---|
| S2 | 1.010 | 0.997 | 0.995 |
| S1 | 0.997 | 1.000 | 1.000 |
| S3 | 0.995 | 1.000 | 1.000 |
protein domains:
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|
CL33 ----> CL80
No. of shared pairs: :273
CL33 ----> CL59
No. of shared pairs: :139
CL33 ----> CL4
No. of shared pairs: :122
CL33 ----> CL21
No. of shared pairs: :113
CL33 ----> CL60
No. of shared pairs: :95
CL33 ----> CL12
No. of shared pairs: :73
CL33 ----> CL49
No. of shared pairs: :65
CL33 ----> CL119
No. of shared pairs: :31
CL33 ----> CL372
No. of shared pairs: :12
CL33 ----> CL22
No. of shared pairs: :11