| size | 5954 |
| size_real | 5954 |
| ecount | 105754 |
| supercluster | 6 |
| annotations_summary | 0.02% Class_I/LTR/Ty3_gypsy/non-chromovirus/OTA/Ogre_Tat/TatV:Ty3-GAG 0.02% organelle/plastid |
| pair_completeness | 0.448661800486618 |
| pbs_score | None |
| TR_score | None |
| TR_monomer_length | None |
| loop_index | 0.000839771582129661 |
| satellite_probability | 4.28848727092841e-21 |
| consensus | None |
| TAREAN_annotation | Other |
| orientation_score | 1 |
| Species | Read count |
|---|---|
| S2 | 1870 |
| S1 | 2110 |
| S3 | 1980 |
| S2 | S1 | S3 | |
|---|---|---|---|
| S2 | 8720 | 11200 | 10300 |
| S1 | 11200 | 14400 | 13500 |
| S3 | 10300 | 13500 | 12700 |
| S2 | S1 | S3 | |
|---|---|---|---|
| S2 | 1.010 | 1.000 | 0.987 |
| S1 | 1.000 | 0.997 | 1.000 |
| S3 | 0.987 | 1.000 | 1.010 |
protein domains:
|
|
||||||||||
|
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|
CL32 ----> CL11
No. of shared pairs: :278
CL32 ----> CL76
No. of shared pairs: :207
CL32 ----> CL3
No. of shared pairs: :91
CL32 ----> CL4
No. of shared pairs: :47
CL32 ----> CL95
No. of shared pairs: :28
CL32 ----> CL68
No. of shared pairs: :15
CL32 ----> CL141
No. of shared pairs: :15
CL32 ----> CL400
No. of shared pairs: :12
CL32 ----> CL79
No. of shared pairs: :11
CL32 ----> CL1183
No. of shared pairs: :10