| size | 6546 |
| size_real | 6546 |
| ecount | 208833 |
| supercluster | 2 |
| annotations_summary | 0.05% Class_I/LTR/Ty3_gypsy/non-chromovirus/OTA/Ogre_Tat/TatV:Ty3-RT 0.05% organelle/plastid 0.02% Class_I/LTR/Ty1_copia/SIRE:Ty1-GAG 0.02% Class_I/LTR/Ty1_copia/Ikeros:Ty1-INT 0.02% Class_I/LTR/Ty3_gypsy/chromovirus/Tekay:Ty3-RH |
| pair_completeness | 0.495544893762851 |
| pbs_score | None |
| TR_score | None |
| TR_monomer_length | None |
| loop_index | 0.00229147571035747 |
| satellite_probability | 2.60623974767306e-21 |
| consensus | None |
| TAREAN_annotation | Other |
| orientation_score | 1 |
| Species | Read count |
|---|---|
| S2 | 2180 |
| S1 | 2240 |
| S3 | 2120 |
| S2 | S1 | S3 | |
|---|---|---|---|
| S2 | 25300 | 24100 | 23400 |
| S1 | 24100 | 22800 | 22200 |
| S3 | 23400 | 22200 | 21300 |
| S2 | S1 | S3 | |
|---|---|---|---|
| S2 | 0.999 | 1.000 | 1.000 |
| S1 | 1.000 | 0.998 | 1.000 |
| S3 | 1.000 | 1.000 | 0.995 |
protein domains:
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|
CL24 ----> CL16
No. of shared pairs: :683
CL24 ----> CL11
No. of shared pairs: :194
CL24 ----> CL17
No. of shared pairs: :45
CL24 ----> CL12
No. of shared pairs: :20
CL24 ----> CL184
No. of shared pairs: :19
CL24 ----> CL13
No. of shared pairs: :17
CL24 ----> CL14
No. of shared pairs: :13
CL24 ----> CL9
No. of shared pairs: :11
CL24 ----> CL151
No. of shared pairs: :11