| size | 6617 |
| size_real | 6617 |
| ecount | 74927 |
| supercluster | 16 |
| annotations_summary | 0.79% organelle/mitochondria 0.06% Class_I/LINE:LINE-ENDO 0.06% Class_I/LTR/Ty1_copia/SIRE:Ty1-RT 0.03% organelle/plastid 0.02% Class_I/LTR/Ty1_copia/Ivana:Ty1-INT |
| pair_completeness | 0.615478515625 |
| pbs_score | None |
| TR_score | None |
| TR_monomer_length | None |
| loop_index | 0.00392927308447937 |
| satellite_probability | 5.75854876097884e-22 |
| consensus | None |
| TAREAN_annotation | Other |
| orientation_score | 1 |
| Species | Read count |
|---|---|
| S2 | 2120 |
| S1 | 2300 |
| S3 | 2200 |
| S2 | S1 | S3 | |
|---|---|---|---|
| S2 | 7820 | 8640 | 7730 |
| S1 | 8640 | 9700 | 8480 |
| S3 | 7730 | 8480 | 7710 |
| S2 | S1 | S3 | |
|---|---|---|---|
| S2 | 1.000 | 0.998 | 1.000 |
| S1 | 0.998 | 1.010 | 0.991 |
| S3 | 1.000 | 0.991 | 1.010 |
protein domains:
|
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|
CL23 ----> CL26
No. of shared pairs: :127
CL23 ----> CL139
No. of shared pairs: :76
CL23 ----> CL84
No. of shared pairs: :63
CL23 ----> CL7
No. of shared pairs: :24
CL23 ----> CL152
No. of shared pairs: :19
CL23 ----> CL165
No. of shared pairs: :16
CL23 ----> CL641
No. of shared pairs: :10