| size | 8168 |
| size_real | 8168 |
| ecount | 334440 |
| supercluster | 1 |
| annotations_summary | 0.01% Class_II/Subclass_1/TIR/EnSpm_CACTA:CACTA-TPase 0.01% organelle/plastid 0.01% Class_I/LINE:LINE-RT 0.01% Class_I/LTR/Ty3_gypsy/non-chromovirus/OTA/Athila:Ty3-RT 0.01% Class_I/LTR/Ty1_copia/SIRE:Ty1-PROT 0.01% Class_I/LTR/Ty1_copia/SIRE:Ty1-RT 0.01% Class_I/LINE:LINE-ENDO 0.01% Class_I/LTR/Ty1_copia/TAR:Ty1-RT |
| pair_completeness | 0.411927398444252 |
| pbs_score | None |
| TR_score | None |
| TR_monomer_length | None |
| loop_index | 0.000979431929480901 |
| satellite_probability | 6.04066957660451e-21 |
| consensus | None |
| TAREAN_annotation | Other |
| orientation_score | 1 |
| Species | Read count |
|---|---|
| S2 | 2600 |
| S1 | 2710 |
| S3 | 2860 |
| S2 | S1 | S3 | |
|---|---|---|---|
| S2 | 31800 | 35300 | 36200 |
| S1 | 35300 | 38600 | 39900 |
| S3 | 36200 | 39900 | 41200 |
| S2 | S1 | S3 | |
|---|---|---|---|
| S2 | 0.998 | 1.000 | 0.998 |
| S1 | 1.000 | 0.997 | 1.000 |
| S3 | 0.998 | 1.000 | 1.000 |
protein domains:
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|
CL12 ----> CL56
No. of shared pairs: :437
CL12 ----> CL74
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CL12 ----> CL49
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CL12 ----> CL59
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CL12 ----> CL18
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CL12 ----> CL130
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CL12 ----> CL33
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CL12 ----> CL37
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CL12 ----> CL38
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CL12 ----> CL21
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CL12 ----> CL139
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CL12 ----> CL4
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CL12 ----> CL10
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CL12 ----> CL28
No. of shared pairs: :10