| size | 9043 |
| size_real | 9043 |
| ecount | 438570 |
| supercluster | 1 |
| annotations_summary | 0.01% Class_I/LTR/Ty1_copia/Ale:Ty1-RT 0.01% Class_I/LTR/Ty1_copia/Ale:Ty1-INT 0.01% organelle/plastid 0.01% Class_I/LTR/Ty1_copia/Ty1-outgroup:Ty1-INT 0.01% Class_II/Subclass_1/TIR/hAT:hAT-TPase |
| pair_completeness | 0.571056289089646 |
| pbs_score | None |
| TR_score | None |
| TR_monomer_length | None |
| loop_index | 0.00154815879685945 |
| satellite_probability | 1.13992396794032e-21 |
| consensus | None |
| TAREAN_annotation | Other |
| orientation_score | 1 |
| Species | Read count |
|---|---|
| S2 | 2860 |
| S1 | 3160 |
| S3 | 3030 |
| S2 | S1 | S3 | |
|---|---|---|---|
| S2 | 44500 | 49300 | 46100 |
| S1 | 49300 | 54500 | 50700 |
| S3 | 46100 | 50700 | 47300 |
| S2 | S1 | S3 | |
|---|---|---|---|
| S2 | 0.997 | 1.000 | 1.000 |
| S1 | 1.000 | 1.000 | 0.999 |
| S3 | 1.000 | 0.999 | 0.999 |
protein domains:
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|
CL10 ----> CL56
No. of shared pairs: :555
CL10 ----> CL2
No. of shared pairs: :387
CL10 ----> CL28
No. of shared pairs: :127
CL10 ----> CL107
No. of shared pairs: :74
CL10 ----> CL27
No. of shared pairs: :63
CL10 ----> CL155
No. of shared pairs: :60
CL10 ----> CL7
No. of shared pairs: :23
CL10 ----> CL4
No. of shared pairs: :11
CL10 ----> CL9
No. of shared pairs: :10
CL10 ----> CL12
No. of shared pairs: :10
CL10 ----> CL229
No. of shared pairs: :10