| size | 10805 |
| size_real | 10805 |
| ecount | 243435 |
| supercluster | 11 |
| annotations_summary | 0.06% organelle/plastid 0.03% Class_I/LTR/Ty1_copia/Ale:Ty1-RT 0.02% organelle/mitochondria 0.01% Class_I/LTR/Ty1_copia/Ikeros:Ty1-INT 0.01% Class_I/LTR/Ty3_gypsy/chromovirus/Tekay:Ty3-INT 0.01% Class_I/LINE:LINE-ENDO |
| pair_completeness | 0.581065261925666 |
| pbs_score | None |
| TR_score | None |
| TR_monomer_length | None |
| loop_index | 0.0042572882924572 |
| satellite_probability | 1.00051650786948e-21 |
| consensus | None |
| TAREAN_annotation | Other |
| orientation_score | 1 |
| Species | Read count |
|---|---|
| S2 | 3580 |
| S1 | 3620 |
| S3 | 3600 |
| S2 | S1 | S3 | |
|---|---|---|---|
| S2 | 27000 | 27300 | 26800 |
| S1 | 27300 | 27800 | 26900 |
| S3 | 26800 | 26900 | 26500 |
| S2 | S1 | S3 | |
|---|---|---|---|
| S2 | 0.999 | 0.998 | 1.000 |
| S1 | 0.998 | 1.010 | 0.997 |
| S3 | 1.000 | 0.997 | 1.000 |
protein domains:
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|
CL6 ----> CL14
No. of shared pairs: :249
CL6 ----> CL3
No. of shared pairs: :232
CL6 ----> CL16
No. of shared pairs: :142
CL6 ----> CL89
No. of shared pairs: :121
CL6 ----> CL17
No. of shared pairs: :120
CL6 ----> CL45
No. of shared pairs: :87
CL6 ----> CL40
No. of shared pairs: :80
CL6 ----> CL118
No. of shared pairs: :38
CL6 ----> CL106
No. of shared pairs: :31
CL6 ----> CL13
No. of shared pairs: :19
CL6 ----> CL286
No. of shared pairs: :15
CL6 ----> CL239
No. of shared pairs: :12
CL6 ----> CL712
No. of shared pairs: :10