| size | 12355 |
| size_real | 12355 |
| ecount | 345087 |
| supercluster | 2 |
| annotations_summary | 0.19% organelle/plastid 0.04% organelle/mitochondria 0.01% Class_I/LTR/Ty3_gypsy/chromovirus/Reina:Ty3-RH 0.01% Class_I/LTR/Ty1_copia/Ale:Ty1-INT 0.01% Class_II/Subclass_1/TIR/PIF_Harbinger:Harbinger-TPase 0.01% Class_II/Subclass_1/TIR/MuDR_Mutator:MuDR-TPase |
| pair_completeness | 0.5995598135681 |
| pbs_score | None |
| TR_score | None |
| TR_monomer_length | None |
| loop_index | 0.000890327802509106 |
| satellite_probability | 7.63705200701412e-22 |
| consensus | None |
| TAREAN_annotation | Other |
| orientation_score | 1 |
| Species | Read count |
|---|---|
| S2 | 3890 |
| S1 | 4130 |
| S3 | 4340 |
| S2 | S1 | S3 | |
|---|---|---|---|
| S2 | 34400 | 36200 | 38400 |
| S1 | 36200 | 38200 | 40200 |
| S3 | 38400 | 40200 | 42900 |
| S2 | S1 | S3 | |
|---|---|---|---|
| S2 | 0.999 | 1.000 | 1.000 |
| S1 | 1.000 | 1.000 | 0.996 |
| S3 | 1.000 | 0.996 | 1.000 |
protein domains:
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|
CL3 ----> CL14
No. of shared pairs: :724
CL3 ----> CL6
No. of shared pairs: :232
CL3 ----> CL32
No. of shared pairs: :91
CL3 ----> CL95
No. of shared pairs: :57
CL3 ----> CL17
No. of shared pairs: :42
CL3 ----> CL124
No. of shared pairs: :37
CL3 ----> CL148
No. of shared pairs: :29
CL3 ----> CL204
No. of shared pairs: :25
CL3 ----> CL76
No. of shared pairs: :15
CL3 ----> CL16
No. of shared pairs: :13
CL3 ----> CL39
No. of shared pairs: :13
CL3 ----> CL151
No. of shared pairs: :13
CL3 ----> CL11
No. of shared pairs: :12
CL3 ----> CL89
No. of shared pairs: :10