| size | 12468 |
| size_real | 12468 |
| ecount | 1378449 |
| supercluster | 1 |
| annotations_summary | 0.03% Class_I/LTR/Ty1_copia/Tork:Ty1-PROT 0.02% Class_I/LTR/Ty1_copia/Ale:Ty1-INT 0.01% organelle/mitochondria 0.01% Class_I/LTR/Ty3_gypsy/chromovirus/Galadriel:Ty3-INT 0.01% organelle/plastid |
| pair_completeness | 0.48040845404892 |
| pbs_score | None |
| TR_score | None |
| TR_monomer_length | None |
| loop_index | 0.0580686557587424 |
| satellite_probability | 6.99254770169001e-18 |
| consensus | None |
| TAREAN_annotation | Other |
| orientation_score | 1 |
| Species | Read count |
|---|---|
| S2 | 4010 |
| S1 | 4250 |
| S3 | 4210 |
| S2 | S1 | S3 | |
|---|---|---|---|
| S2 | 155000 | 154000 | 153000 |
| S1 | 154000 | 154000 | 152000 |
| S3 | 153000 | 152000 | 151000 |
| S2 | S1 | S3 | |
|---|---|---|---|
| S2 | 1.000 | 0.999 | 1.000 |
| S1 | 0.999 | 1.000 | 0.998 |
| S3 | 1.000 | 0.998 | 1.000 |
protein domains:
|
|
||||||||||||||||||||||||
|
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|
CL2 ----> CL31
No. of shared pairs: :1069
CL2 ----> CL10
No. of shared pairs: :387
CL2 ----> CL7
No. of shared pairs: :80
CL2 ----> CL136
No. of shared pairs: :75
CL2 ----> CL1
No. of shared pairs: :65
CL2 ----> CL156
No. of shared pairs: :64
CL2 ----> CL79
No. of shared pairs: :42
CL2 ----> CL159
No. of shared pairs: :31
CL2 ----> CL4
No. of shared pairs: :21
CL2 ----> CL26
No. of shared pairs: :12
CL2 ----> CL305
No. of shared pairs: :12
CL2 ----> CL9
No. of shared pairs: :10