| size | 14025 |
| size_real | 14025 |
| ecount | 96380 |
| supercluster | 3 |
| annotations_summary | 0.02% organelle/plastid 0.01% organelle/mitochondria 0.01% Class_I/LTR/Ty1_copia/Tork:Ty1-RT |
| pair_completeness | 0.556085654055253 |
| pbs_score | None |
| TR_score | None |
| TR_monomer_length | None |
| loop_index | 0.00171122994652406 |
| satellite_probability | 1.29477276776204e-21 |
| consensus | None |
| TAREAN_annotation | Other |
| orientation_score | 1 |
| Species | Read count |
|---|---|
| S2 | 4520 |
| S1 | 4740 |
| S3 | 4760 |
| S2 | S1 | S3 | |
|---|---|---|---|
| S2 | 10200 | 10300 | 10600 |
| S1 | 10300 | 10900 | 11000 |
| S3 | 10600 | 11000 | 11400 |
| S2 | S1 | S3 | |
|---|---|---|---|
| S2 | 1.020 | 0.992 | 0.993 |
| S1 | 0.992 | 1.010 | 0.997 |
| S3 | 0.993 | 0.997 | 1.010 |
protein domains:
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CL1 ----> CL27
No. of shared pairs: :731
CL1 ----> CL38
No. of shared pairs: :376
CL1 ----> CL30
No. of shared pairs: :146
CL1 ----> CL103
No. of shared pairs: :106
CL1 ----> CL2
No. of shared pairs: :65
CL1 ----> CL274
No. of shared pairs: :26
CL1 ----> CL507
No. of shared pairs: :15
CL1 ----> CL37
No. of shared pairs: :14
CL1 ----> CL393
No. of shared pairs: :14
CL1 ----> CL508
No. of shared pairs: :14
CL1 ----> CL435
No. of shared pairs: :10