Biophysical Chemistry and Molecular Oncology

Running projects

Development of Electroanalytical Methods for Interaction of Galectins and Glycomimetic Ligands – New Potential Anticancer Drugs

Electroactive and fluorescent modifications of nucleic acids for structure & interaction studies and for applications in diagnostics

Local DNA structures and their role in mutant p53 protein function in human tumours

New tools for research and diagnostics of glycans and glycoproteins using electrochemical analysis and chemical modification

Development of a sensitive and selective electrochemical genosensor for on-site detection of Citrus Bark Cracking Viroid (CBCVd)

Finished projects

Study of electrochemical and adsorption processes on nanostructured sp2 and sp3 carbon surfaces in relation to their physico-chemical characteristics

Tuning of electrochemical properties of boron polyhedral by advanced substitutions towards their use in bioconjugates: systematic basic research

Guanine quadruplex-mediated functions of p53, p63 and p73 proteins in cancer biology

Comparative study of DNA interacting properties of the tumor suppressor p53 protein isoforms

New tools of label-free electrochemical analysis of protein interactions with nucleic acids and proteins

Nanostructured surfaces of silver amalgam for electrochemical and optical methods of biomolecule analysis

Chemical modification and electrochemical analysis of nucleic acids as a new tool in molecular oncology

Struktura DNA v roztoku a na površích elektrod: elektrochemické metody jako účinné nástroje analýzy struktury a interakcí DNA

Centrum nových přístupů k bioanalýze a molekulární diagnostice

New tools for research and diagnostics of diseases. Microfluidic reactors and electrochemistry for analysis of proteins and their glycosylation.

Influence of conformation motifs and epigenetic modifications to DNA binding properties of p53 family proteins

Novel reactive groups introduced in nucleic acids for modification with oxoosmium complexes: structural and analytical aspects.

Interactions of p53 family proteins with biologically significant DNA quadruplexes

Rozvoj moderních trendů v experimentální biologii: význam biomolekulárních interakcí pro funkci buněčných struktur

Optical and electrochemical approaches to study the adsorption behavior of proteins at the metal interfaces for use in medical applications

Nové elektrochemické senzory a detekční techniky pro analýzu struktury a interakcí nukleových kyselin.

Vazba na DNA, stresem indukovaná exprese a transaktivační aktivita izoforem proteinu p73

Influence of conformation and chemical modification on the behaviour of oligonucleotides at electrodes: towards the development of DNA sensors

Induced organization of biomolecules at interfaces by interacting with electrically charged surfaces as a tool for medical diagnostics

Spectroscopic and electrochemical characterization of photo-oxidized proteins

Značení DNA redoxními markery pro elektrochemickou detekci. Aplikace v analýze nukleotidových sekvencí a v molekulární diagnostice.

Konstrukce nových funkčních nukleových kyselin pro aplikace v chemické biologii, katalýze a samoskladbě

The role of p53 DNA structure-selective binding in brain cancer.

Reaction of Six-valent and Eight-valent Osmium Complexes with Biomacromolecules and Their Application in Biomedicine.

Transcriptional activities of wild-type and mutant p53, decision between cell proliferation, cell cycle arrest and apoptosis.

Moderní biofyzikální metody: pokročilé praktické vzdělávání v experimentální biologii

Interakce proteinů a nukleových kyselin s povrchy. Nové nástroje pro biomedicínu

Aggregation of alpha synuclein in Parkinson's disease

Complex interaction of oncology-related important transcription factors with target DNA in vitro and in vivo

Aggregation of alpha synuclein in Parkinson’s disease.

Complex interaction of oncology-related important transcription factors with target DNA in vitro and in vivo.

Interactions of proteins and nucleic acids with surfaces. New tools for biomedicine.

Mezifázové a elektrochemické chování syntetických oligonukleotidů: vliv nukleotidové sekvence, konformace a chemické modifikace

Mezifázové vlastnosti alfa-synucleinu a agregace tohoto proteinu v Parkinsonově nemoci

Stomatological Research Center.

Aplikace elektrochemických metod zaměřených na mikroanalýzu bází nukleových kyselin a oligonukleotidů

Využití fyzikálních metod studia adsorpce nukleových kyselin a proteinů na rozhraních v lékařské diagnostice a při studiu biokompatibility

Bioinformatická a experimentální identifikace nekanonických struktur v genomové DNA

Elektrochemické nástroje pro detekci mutací a polymorfismů v DNA

Interakce standardního a mutantních proteinů p53 s poškozenou DNA a jejich význam při odpovědi buněk na protinádorovou chemoterapii

Elektrochemická a optická analýza biomakromolekul na mikroelektrodách pokrytých nanovrstvami elektroaktivního materiálu

Nanotechnologie pro proteinovou a genovou diagnostiku

Centrum biofyzikální chemie, bioelektrochemie a bioanalýzy. Nové nástroje pro genomiku, proteomiku a biomedicínu.

Analýza struktury a interakcí DNA pomocí elektrochemických technik a chemických sond. Nové metody a senzory pro detekci poškození DNA

Elektrody modifikované proteiny a DNA. Nové nástroje pro biomedicínu

Interakce proteinů s povrchy. Nové biofyzikální metody analýzy nádorového supresoru p53

Interakce proteinu p73 a jeho isoforem s DNA. Vliv nadšroubovicového vinutí, konformace DNA a protinádorových činidel

Studium posttranslační modifikace nádorového supresoru proteinu p53, jeho homologů a interagujících proteinů v lidských nádorových buněčných liniích

Nové přístupy v elektrochemické analýze nukleových kyselin a oligonukleotidů zaměřené na ultrasensitivní mikrodetekci DNA a detekci DNA hybridizace.

Využití elektrochemických metod při studiu oligonukleotidů jako modelů alternativních struktur DNA

Mikroanalytická instrumentace pro analýzy biopolymerů modifikovaných strukturními sondami

DNA vytvářející triplexy a jejich interakce s proteiny p53

Standardní (wild type) a mutovaný nádorový supresor protein p53. Mezimolekulární interakce, změny konformace a nové mikrometody jeho analysy

Aplikace biofyzikálních metod v biotechnologii a v biomedicině.

Mutanty nádorového supresoru proteinu p53 a regulace jejich DNA vazebné aktivity

Konjugáty nukleobází s komplexy kovů jako elektroaktivní značky. Využití značených oligonukleotidů v senzorech pro hybridizaci DNA

Sensibilizace nádorových buněk k chemoterapeutikům cílenými inaktivacemi p53-kináz a homologů p53 jako možná terapeutická strategie v onkologii

Elektrochemické detektory hybridizace DNA a jejich aplikace v DNA diagnostice

Výzkum a vývoj nového typu elektrochemického biosenzoru pro detekci sekvence nukleotidů v DNA a genotoxických agens v prostředí.

Interakce mutantních proteinů p53 s genomovou DNA in vitro a in vivo

Interakce biopolymerů s ligandy a detekce jejich konformačních změn na fázových rozhraních pomocí elektrochemických a optických metod

Nové přístupy ve vývoji elektrochemických senzorů pro poškození DNA

Vliv superhelicity DNA na sekvenčně specifickou a strukturně selektivní vazbu proteinu p53

Možnosti elektrochemických metod v genomice, základy vývoje biosenzorů DNA

Využití chemických strukturních sond a elektroanalytických metod při detekci poškození DNA. Vývoj DNA senzorů.

Chemicky modifikované pevné elektrody v elektrochemické analýze nukleových kyselin a jejich složek

Využití elektrochemie v analýze proteinů a při detekci hybridizace DNA

Vývoj metod a konstrukce sensorů pro detekci interakcí DNA s léky

Rozpoznání poškození DNA nádorově supresorovými proteiny. Vliv protinádorových léčiv.

Aplikace biofyzikálních metod v biotechnologické a klinické praxi

Interakce nádorově supresorových proteinů s DNA. Úlohy konformace DNA a modifikací proteinu.

Vývoj elektrochemických biodetektorů pro poškození DNA.

Interakce nádorově supresorového proteinu p53 s poškozenou DNA a s DNA vystavenou působení léků proti nádorovým onemocněním.

Elektrody jako regulátory štěpení imobilizované DNA chemickými nukleázami závislými na redoxních reakcích.

Application of biophysical methods in biotechnology and biomedicine

6FP EU, MERG-6-CT-2005-014875, European Reintegration Grant, „Novel interactions of mutant p53 with genomic DNA in vitro and in vivo“,

Mutant p53 a target for improved cancer treatment

New chemical and biochemical sensors for analysis of food, enviromental and medical samples

Development of methods and construction of sensors for the detection of interaction of DNA with drugs

Study of DNA hybridization at surfaces

Application of biophysical methods in biotechnology and biomedicine